基因遗传学家苏珊博士所领导的研究小组，想要探索可以改变物种的基因，他们在位于海洋的实验室做研究，她以聪明而且有攻击力、生命力都很强的杀人鲸作为改造基因的实验对象，他们发现从这种鱼脑中所萃取的酵素可以治疗脑癌。
这项发现让出资的金主罗素等人，在墨西哥海岸砸钱养鲨鱼。他们需要脑容量大的鲨鱼，可是这些鲨鱼也是比较聪明的鱼类。其中罗素是个神经质的人，他觉得这种基因实验的本质违背自然运行之理，会遭到报应，于是就在实验接近大功告成之际，他中途破坏，使得实验中最大一只杀人鲸的脑部纤维组织，遭到不可预期的改变，它冲破防线，让湛蓝深海血腥四布。
热带风暴即将来临，凶猛的杀人鲸随时有可能出现并咬死人，在孤立无援的海上，苏珊博士一行人到底要如何救出自己？