这是一个没有希望的世界，没有雨、没有粮食，军阀和野蛮的游牧部落统治一切。因为蛮荒大地上的人类造孽恶贯满盈。造物主决心以一场无尽豪雨，让一切罪恶及人类从此淹没；唯有受命于天的挪亚才可独善其身，有资格带领家人和生灵万物逃过一场浩劫；为人类、地球上不同物种挽留最后血脉。
因此挪亚每天晚上都会被一个噩梦所折磨，梦里整个世界被一场大洪水吞没。久而久之他意识到，这正是造物主给他的讯号，造物主要惩罚人类，把他们杀光……为人类、地球上不同物种挽留最后血脉。造物主暗中遣派巨灵石兽守护挪亚一家。正当争分夺秒搭建方舟求生之际，挪亚的敌人土八该隐正率领大批人马为从挪亚和巨灵石兽手中抢占方舟而作军事准备，挪亚的二儿子含也因其喜欢的女人未得到父亲的救助去世而与父亲生恨，含为此不惜阴谋勾结挪亚家族的世仇土八该隐。大限将至，为争夺方舟和惊天解密的唯一机会，土八该隐、含和冥顽不灵的罪人向挪亚发动洪荒灭世前的正邪最后激战。