中国明朝景泰八年（1457年），明英宗发动夺门之变，重新复辟，太子太傅、兵部尚书于谦受专权太监诬陷，以通谋藩王，觊觎大宝罪名判处死刑，家属充军龙门。东厂暨锦衣卫（下简称番子，即特务）头子曹少钦派人至龙门截杀于谦家人。番子大档头皮绍棠、二档头毛宗宪带队抵达龙门客栈，要账房与店小二不再收客人，又问得附近有守兵12人，为免妨碍任务前往歼灭。皮、毛外出时，一名叫萧少镃，带着伞的斯文男子执意投店，一名番子依三档头指示在萧少镃的酒下毒未果，被萧强灌毒酒而死。大档头闻讯返回，见萧少镃技艺不凡，难以轻易打发，便为属下赔罪，攀谈了解其来意，并称自己在刑部当差，来龙门办案。萧只说自己是掌柜的朋友，特来拜访。大档头软言请萧暂时离开客栈以便办案，萧慨然应允。
离开客栈后碰上回来的掌柜吴宁，萧描述皮绍棠一行人，原来萧是吴宁特地找来的，但尚不知吴所为何事。吴急与萧赶回客栈。当天又有一对兄弟坚持投店，萧、吴出面拒绝其投宿，然而皮绍棠主动留他们下来。晚饭时，哥哥朱骥莽撞地问，在路上是否看到押解犯人？犯人是一男一女，带着个孩童。这一问所有人均留上了心。皮作无事状，问可知要找的人姓什么，发配到什么地方？弟弟朱辉忙胡诌了答案。二档头也作无事状，使属下拿酒。店小二见又使人进厨房，有了白天萧被下毒的经验，找空档与吴宁说了。萧借着敬酒传给朱辉字条，于是下毒又没成功。
夜晚皮、毛计议已定，由毛到萧、朱厢房分掷暗器，成功引得朱骥找萧少镃动手。骚动中，有眼无珠的萧少镃贴身擒拿朱辉时才赫然发现朱是女儿身。吴宁藉问骚动原因之便，通知萧、朱三人暗中至其房间集合，原来吴宁曾是于谦手下参军，早已认出朱氏兄妹是于谦故人。第二日押解于谦家属的官差队伍投店，店内番子通知皮、毛，监视番子行动的吴宁等四人亦分别回转店内。进行若干回接战后，毛宗宪战死，番子撤退，吴宁等四人、于家三人与押解的官差返回客栈。吴宁在客栈内为两边伤者疗伤。一位东厂番子多剌与其弟假装昏迷留下来，表示亦曾在于谦帐下效力，愿加入吴宁等人。讨论曹少钦武功时，多剌兄弟小露一手快剑，显示了前一晚饭桌上留了一手、截然不同的功力。夜晚状况外的总兵归玉章来访，问吴宁12个守兵如何被杀害？第二天曹少钦抵达龙门，射入最后通牒，状况外的归总兵寻曹理论被杀。番子进攻客栈时发现吴宁等人布下陷阱，事先离去。行进中的吴宁一行人终被番子包围，展开战斗，击杀皮绍棠后，萧少镃、朱骥、多剌兄弟与曹鏖战，多人伤亡下，终于由多剌以同归于尽的方式，成功斩杀曹少钦。