故事发生在精灵宝可梦世界,超梦从实验室逃出来时,发生警探哈利·古德曼的车祸事故。21岁的蒂姆原本梦想成为宝可梦训练家,但母亲去世、父亲哈利因警务工作而与他分隔两地,让蒂姆放弃了梦想,从事保险业务员工作。某日,他接到哈利在查案时殉职的噩耗。蒂姆来到哈利的工作地点莱姆市,这个城市禁止宝可梦对战,并力求人类与宝可梦共同生活。跟哈利的好友吉田探长会谈后,蒂姆前往父亲的公寓并遇见想成为记者的露西·史蒂文斯及其搭档可达鸭,露西认为哈利的死必有蹊跷。蒂姆在父亲的房间里遇见一只皮卡丘,这只戴猎鹿帽的皮卡丘会说人类的话,但只有蒂姆能听得懂。蒂姆不小心打开了装有紫色有害气体的试管,一群长尾怪手受此影响发狂攻击他和皮卡丘,所幸他们平安脱困。皮卡丘表示自己是失忆的名侦探,也是哈利的搭档。他坚信哈利并没有死,而...